Un10R, кодировка самая нормальная, куда уж лучше корявейшей КОИ‑8. Софт в том месте кривой, в котором перестаёт нормально воспринимать и другие кодировки. Такова судба всех юниксподобных систем. Если уж программер не удосужился сделать всё как надо, то это очередная опенсорц поделка и лучше поискать что‑нибудь стоящее.